مرکز تحقیقات انگل های بومی ایران بر آن است تا با اولویت بندی برنامه های پژوهشی مرتبط با انگل شناسی پزشکی در کشور با هماهنگی انجمن انگل شناسی ایران، بستر سازی لازم جهت انجام پژوهش بنیادی-کاربردی بر روی انگل های بومی ایران با تاکید بر عفونت های انگلی، تربیت پژوهشگران و پاسخ لازم به دست اندرکاران اجرائی کشور به منظور برنامه ریزی جهت کنترل و پیشگیری این عفونت ها در انسان، برقراری ارتباط علمی – پژوهشی با گروه های مختلف علوم پایه و بالینی مرتبط با انگل های بومی ایران و کمک به توسعه دانش پایه انگل شناسی در کشور گام بردارد.